Es un archipiélago formado por 2 islas grandes y 13 islotes o cayos, con aguas claras y con una gran diversidad con unas 115 especies de corales y más de 150 de peces. 60 de esas especies es posible observarlas en las zonas autorizadas de snorkel. Todo un festival de colores con peces loros y cirujanos, además del coral cerebro, abanico y cuerno de venado.
La parte terrestre tiene dos especies icónicas. La boa rosada de Cayos Cochinos y el jamo negro, una iguana de cola espinosa y endémica de la zona.